生物信息学分析(用生物信息学怎么分析一个基因的结构与功能)

目前常用生物信息学分析方法有哪些

现在比较热门的数据库包括GEO、TCGAGEO分析主要是芯片做差异分析,得到差异基因,差异基因可以做GO、KEGG功能富集分析TCGA数据库是癌症分析的利器,可以做差异基因,差异miRNA,差异lncRNA,下载和整理临床数据,做生存分析,高难度的COX分析这两个数据库可以发到不错的文章

生物信息学分析(用生物信息学怎么分析一个基因的结构与功能)

生物信息学的内容,主要数据库,哪些分析方法?

生物信息学是一门交叉科学,它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面,它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。在DNA序列方面有GenBank、EMBL和DDBJ等。在蛋白质一级结构方面有SWISS-PROT、PIR和MIPS等。在蛋白质和其它生物大分子的结构方面有PDB等。在蛋白质结构分类方面有SCOP和CATH等。研究内容:序列比对(Alignment)。结构比对;蛋白质结构预测,包括2级和3级结构预测;计算机辅助基因识别(仅指蛋白质编码基因);非编码区分析和DNA语言研究;分子进化和比较基因组学;序列重叠群(Contigs)装配;遗传密码的起源;基于结构的药物设计;其他如基因表达谱分析,代谢网络分析;基因芯片设计和蛋白质组学数据分析等,逐渐成为生物信息学中新兴的重要研究领域。BLAST,GENSCAN,PRIMERDESIGN,CLUSTER,……

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